經(jīng)典的MHCⅠ類抗原呈遞，也成為直接呈遞，一般呈遞內(nèi)源性的抗原肽。病毒感染后，在細(xì)胞質(zhì)中翻譯后的病毒蛋白或者內(nèi)源性的宿主蛋白，都遵循該途徑。這些蛋白質(zhì)（抗原）經(jīng)過蛋白酶體的降解后，其中TAP依賴的肽會(huì)被轉(zhuǎn)位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中；內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的肽裝載復(fù)合物PLC，由TAP、鈣蛋白、ERp57和脂肪蛋白組成，負(fù)責(zé)組裝并驅(qū)動(dòng)MHCⅠ類蛋白的折疊，ERAAP/ERAP1（內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨基肽酶）介導(dǎo)修剪后的肽裝載，進(jìn)而形成PLC-MHCⅠ-肽復(fù)合物，然后MHCⅠ類分子上的高親和力肽從PLC釋放并呈遞細(xì)胞表面，激活相應(yīng)的CD8+T細(xì)胞和啟動(dòng)特異性免疫反應(yīng)。空載的MHCⅠ分子在細(xì)胞質(zhì)中被蛋白酶體降解。 MHCⅡ類分子負(fù)責(zé)外源性抗原的呈遞，通過抗原呈遞細(xì)胞APCs（如樹突狀細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和B淋巴細(xì)胞）來吞噬消化抗原肽。蛋白質(zhì)內(nèi)化由APCs的高親和性的BCR介導(dǎo)。顆粒微生物內(nèi)化為吞噬溶酶體，蛋白被消化成肽段。MHCⅡ在ER中形成二聚體并且結(jié)合Li，從高爾基體定向運(yùn)輸?shù)酵砥诎麅?nèi)體隔室MⅡC，這是抗原肽加工并且和MHCⅡ分子結(jié)合的場(chǎng)所。MⅡC中的蛋白酶體將抗原和Li降解后，MHCⅡ得以和肽結(jié)合，然后穩(wěn)定的MHCⅡ-肽復(fù)合物被轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞表面，并被CD4+T細(xì)胞識(shí)別。CD4+T細(xì)胞被激活后，觸發(fā)巨噬細(xì)胞消除已經(jīng)內(nèi)化的病原體以及B淋巴細(xì)胞產(chǎn)生致病特異性抗體。